Банк создан в 1992 году как Инвестиционный территориальный коммерческий банк «Клиппер». В 1993 году получил новое наименование — «Северная Казна», а в 1998 году преобразован в открытое акционерное общество.
Осенью 2008-го один из крупнейших и наиболее технологичных банков Уральского региона «Северная Казна» не выдержал массированного оттока клиентской базы, вызванного не только разразившимся кризисом, но и мощной контрпропагандистской информационной атакой. Тогда еще основной владелец банка Владимир Фролов решил продать банк в аврально-пожарном порядке, в результате чего при участии Агентства по страхованию вкладов и Банка России контроль над «Казной» перешел к Альфа-Банку — сейчас ему принадлежит 85% акций уральского банка. К середине 2009-го года новые владельцы обещают завершить ребрендинг и перевод екатеринбургского банка на платформу Альфа-Банка, а также «оптимизацию» стремительно редеющей сети продаж.
По сравнению с докризисными временами активы «Северной Казны» сократились почти вдвое, а частные вклады — почти втрое. В рэнкинге российских кредитных организаций банк опустился на 95-е место против 68-го на 01.01.2007.
